Marc St-Arnaud – étudiants

Étudiants au doctorat

  • Fahad Al Otaibi
    (codirection pour Mohamed Hijri)

    « Analyse de la diversité biologique microbienne et fongique des sols contaminés par des polluants organiques et inorganiques »

  • Andrew Blakney
    (codirection pour Mohamed Hijri)

    « How do oomycete and bacterial microbiomes interact in the roots of different Brassica species? »

  • Jean-Baptiste Floc’h
    (codirection: Mohamed Hijri, Chantal Hamel, Agriculture et Agroalimentaire Canada)

    « Caractérisation du microbiome de B. napus et alliées par une approche écologique de réseau d’interaction et séquençage haut débit »

  • Pranav Pande

    (codirection pour Etienne Yergeau, INRS-IAF)

    « Fonctions microbiennes et pratiques agricoles »

  • Liliana Quiza Moreno
    (codirection pour Etienne Yergeau, INRS-IAF)

    « Étude du microbiome du blé par métagénomique et métatranscriptomique »

  • Michael Sabeh
    (codirection: Benjamin Mimee, Agriculture et Agroalimentaire Canada)

    « Étude du génome de Globodera rostochiensis et influence de la symbiose mycorhizienne à arbuscules sur l’infection de Solanum tuberosum« 

Chercheurs post-doctoraux et agents de recherche

  • Jacynthe Masse, chercheure post-doctorale
    (codirection Mohamed Hijri)

    « Effect of crop rotations on microbial diversity and functions in agricultural systems »

Étudiants et chercheurs ayant terminé

  • Rim Klabi, chercheure post-doctoral. Effect of crop rotations on microbial diversity in the great North American plains.
  • Jean-Baptiste Floc’h, M.Sc. 2018. Recherche d’indicateurs de réponse à la symbiose mycorhizienne arbusculaire chez le blé. Codirection Chantal Hamel, Agriculture et Agroalimentaire Canada.
  • Thomas Joseph Pray, Ph.D. 2017. The effect of mycorrhizal fungi associated with willows growing on marginal agricultural land. Codirection Michel Labrecque.
  • Charlotte Marchand, Ph.D. 2017. Phytoremediation of petroleum hydrocarbons and trace elements contaminated soil. Codirection Mohamed Hijri.
  • Fanny Rohrbacher, M.Sc 2017. Structure fonctionnelle du plasmidome rhizosphérique dans un contexte de contamination aux hydrocarbures us différentes largeurs d’ouvertures de la canopée.
  • Katrina Dingle-Abram, assistante de recherche 2015-2016. Metagenomic and metatranscriptomic analyses of the soil microbiome.
  • Mulan Dai, chercheur post-doctoral 2016. Microbiome and crop productivity. Codirection Mohamed Hijri.
  • Rim Klabi, Ph.D. 2015. Contribution des légumineuses, des champignons endophytes et mycorhiziens dans la nutrition azotée des prairies indigènes semi-arides. Codirection Chantal Hamel, Agriculture et Agroalimentaire Canada.
  • Terrence Bell, chercheur post-doctoral 2015. Genorem Project: The effects of microbial competition on bioremediation and bioaugmentation success in willow-planted contaminated soils.
  • Ivan de la Providencia, agent de recherche 2015. Projet Genorem: Isolation and characterization of soil microbes for bioremediation. Codirection Mohamed Hijri.
  • David Denis, aide à la recherche 2015. Projet Genorem: isolation et conservation de microorganismes. Codirection Mohamed Hijri.
  • Sébastien Halary, agent de recherche 2015. Projet Genorem: métagénomique et métatranscriptomique microbienne en sols contaminés. Codirection Mohamed Hijri.
  • Yves Terrat, agent de recherche 2015. Projet Genorem: métagénomique et métatranscriptomique microbienne en sols contaminés. Codirection Mohamed Hijri.
  • Rim Ben Haj Sassi, M.Sc. 2014. Variabilité intra et interspécifique chez les champignons mycorhiziens à arbuscules et biocontrôle de la fusariose. Codirection Mohamed Hijri.
  • Saad El-Din Hassan, chercheur post-doctoral 2011-2012. Projet Genorem: structure et fonctions des communautés bactériennes et fongiques en sols contaminés. Codirection Mohamed Hijri
  • Abdelghani El Yassimi, chercheur post-doctoral 2011-2012. Projet Genorem: isolation et caractérisation de bactéries et champignons efficaces pour la bioremédiation. Codirection Mohamed Hijri
  • Cristina Micali, stage post-doctoral 2010-2012. Développement de marqueurs moléculaires et d’un protocole de qPCR pour la quantification des champignons mycorhiziens à arbuscules à partir d’échantillons de champ en production de blé.
  • Saad El-Din Hassan, Ph.D. 2011. Effet de la pollution urbaine et industrielle sur la biodiversité microbienne du sol et identification des organismes hautement tolérants pour des fins de décontamination. Codirection Mohamed Hijri.
  • Walid Ellouz, Ph.D. 2011. Étude de l’impact des génotypes de pois chiche sur la biodiversité des mycorhizes à arbuscules et de la communauté microbienne du sol. Codirection Chantal Hamel, Agriculture and Agri-Food Canada, Swift Current SK, cotutelle Pr. Sadok Bouzid, Université Tunis El Manar, Tunisie.
  • Marie-Soleil Beauregard, Ph.D. 2010. Impact de différentes fertilisations sur la biodiversité microbienne de sols agricoles. Codirection C. Hamel, Agriculture and Agri-Food Canada, Swift Current SK.
  • Julie Lecomte, M.Sc. 2010. Étude de l’interaction entre le champignon mycorhizien Glomus irregulare et les bactéries du sol. Codirection pour Mohamed Hijri.
  • Nadia Zéramdini, M.Sc. 2009. Étude du polymorphisme intra- et inter-spécifique du gène β-tubuline chez des espèces de champignons mycorhiziens à arbuscules en vue de développer des marqueurs moléculaires. Codirection pour Mohamed Hijri.
  • Laurence Bissonnette, M.Sc. 2009. Efficacité d’espèces ligneuses en symbiose mycorhizienne arbusculaire pour la phytoremédiation d’un site urbain contaminé. Codirection pour Michel Labrecque, IRBV.
  • Erin Zimmerman, M.Sc. 2009. Ségrégation et répartition des génomes du champignons mycorhizien à arbuscules Glomus etunicatum au sein du réseau mycélien en fonction des plantes hôtes. Codirection Mohamed Hijri.
  • Rosalie Lefebvre, M.Sc. 2007. Réhabilitation d’un brownfield de la ville de Montréal par des approches de phytoremédiation. Co-direction pour Michel Labrecque, IRBV.
  • Laëtitia Lioussanne, Ph.D. 2007. Rôles des modifications de la microflore bactérienne et de l’exsudation racinaire de la tomate par la symbiose mycorhizienne dans le biocontrôle sur le Phytophthora nicotianae. Codirection M. Jolicoeur, École Polytechnique de Montréal.
  • Mélanie Paulin, M.Sc. 2007. Étude moléculaire de l’antibiose en condition in situ et de son impact sur la résistance aux maladies racinaires. Codirection Martin Filion, Université de Moncton.
  • Christine Martineau, M.Sc. Laval 2006. Étude des interactions entre quatre souches bactériennes et le champignon mycorhizien Glomus intraradices dans la rhizosphère de la tomate. Codirection H. Antoun, Université Laval.
  • Étienne Yergeau, M.Sc. 2004. Caractérisation moléculaire de la biodiversité des Fusarium associés à la fusariose de l’asperge (Asparagus officinalis L.) au Québec. Codirection V. Vujanovic, IRBV.
  • Martin Filion, PDF 2003. Caractérisation moléculaire des communautés bactériennes et fongiques de la rhizosphère de plants d’épinettes noires en pépinière, selon leur état de santé. Collaboration avec Louis Bernier, Université Laval et Richard Hamelin, Service canadien des forêts.
  • Martin Filion, Ph.D. McGill 2002. The application of real-time PCR to investigate the effect of the arbuscular mycorrhizal fungus Glomus intraradices on the plant pathogen Fusarium solani f.sp. phaseoli. Codirection S.H. Jabaji-Hare, McGill.
  • Karine Labour, M.Sc. 2002, Caractérisation nutritionnelle de lignées de recines transformées de tomate, en relation avec la symbiose endomycorhizienne à arbuscules. Codirection Mario Jolicoeur, École Polytechnique de Montréal
  • Jean-Patrick Toussaint, M.Sc. Université d’Ottawa 2002, Nitrogen transfer and assimilation in a mycorrhizal in vitro root culture system. Codirection C. Charest, Université d’Ottawa.
  • Louis Dussault, M.Sc. 2000. Étude sur la germination des graines du Spiranthes cernua (L) Rich. et du Cypripedium acaule Ait. en présence de champignons mycorhiziens des Orchidacées. Codirection D. Barabé et J.A. Fortin.
  • Brigitte Vimard, M.Sc. 1999. Induction des mécanismes de résistance chez des plantules de carottes (Daucus carota) colonisées par un champignon endomycorhizien arbusculaire (Glomus intraradices) et infectées par le Pythium ultimum Trow. Codirection J.A. Fortin.
  • Martin Filion, M.Sc. 1998. Interactions mycorhizosphériques entre un champignon endomycorhizien arbusculaire (Glomus intraradices) et différents micro-organismes édaphiques. Codirection J.A. Fortin.
  • Sonja Kosuta, M.Sc. McGill 1998. Movement of cupper from in-ground root control fabrics. Codirection C. Hamel, McGill.

+ Centre sur la biodiversité